اتاق تمیز بصورت مشخص، فضایی است که در عملیات ساخت داروها و فرآورده های بیولوژیک یا پژوهش های علمی کاربرد دارد . این گونه فضاها مشخصاً دارای سطح پائینی از آلوده کننده هایی همچون گرد و غبار، میکروب های منتقل شده از راه هوا، ذرات معلق و بخارات شیمیایی هستند. یک مرکز تولید ممکن است شامل هزاران متر سطح اتاق تمیز باشد. اتاق های تمیز در سطح وسیعی در صنایع نیمه هادی، بیوتکنولوژی، بیولوژی و مواد دیگری که به آلودگی های محیطی حساس هستند مورد استفاده قرار می گیرند.
هوای ورودی به اتاق تمیز، به منظور حذف ذرات گرد و غبار و ذرات دیگر، فیلتر شده و هوای داخل فضای تمیز نیز بطور مداوم از طریق عبور از فیلترهای مخصوص به منظور حذف آلودگی های ایجاد شده در داخل فضای تمیز مجدداً به گردش در می آید.
کارکنان فضاهای تمیز از طریق هوابند که گاهی مجهز به دوش هوا نیز می باشند، به فضای تمیز وارد شده یا از آن خارج می شوند و از لباس های محافظتی مانند کلاه، ماسک صورت، دستکش، کفش ساق بلند و لباس سرتاسری استفاده می نمایند .
تجهیزات داخل اتاق تمیز به صورتی طراحی می شوند که حداقل آلودگی را ایجاد نمایند. این مسئله وسائل نظافتی را نیز شامل می شود. وسائل و ابزار مورد استفاده در فضاهای تمیز نیز به نحوی تولید می شوند که حداقل ذرات را تولید نموده و به راحتی تمیز شوند.
مواد رایج مورد استفاده در اینگونه فضاها مانند کاغذ ، مداد و پارچه مورد مصرف نظافت که منشا طبیعی دارند، معمولاً حذف می شوند و به جای آنها از جایگزین های مصنوعی که ذره زا نیستند، استفاده می شود .
اتاق های تمیز استریل نیستند، بلکه عاری از میکروب ها و ذرات غیر کنترل شده هستند. در این رابطه توجه خاصی به ذرات قابل انتقال از طریق هوا معمول می گردد. ذرات موجود در فضاهای تمیز، معمولاً با دستگاه های ذره سنج اندازه گیری می شوند.
در اتاق های تمیز سطح پایین ممکن است فقط استفاده از کفش مخصوص (کفش هایی با کف نرم و صاف) لازم باشد تا گرد و غبار و کثافات از طریق شیارهای کف کفش به داخل فضای تمیز وارد نشوند. به هر حال کف کفش ها نباید ذرات خطرناک آزاد نماید.
حفاظت از ذرات در اتاق های تمیز از طریق استفاده از فیلترهای مخصوص و بکار گیری جریان هوای یکنواخت (لامینار فلو) یا جریان هوای غیر یکنواخت یا مغشوش صورت می گیرد . در جریان هوای یکنواخت یا جریان غیر یکنواخت سیستم جریان هوا بصورتی است که هوای فیلتر شده به سمت پائین و فیلترهایی که در قسمت پائین دیوار و نزدیک کف فضای تمیز نصب شده اند هدایت می شود . در ساخت دستگاه های تولید جریان هوای یکنواخت به منظور پیشگیری از آزاد شدن ذره، از استیل یا مواد غیر ذره زا استفاده می شود.
در فضاهای دارای جریان هوای غیر یکنواخت (مغشوش ) برای انجام کارهای حساس، از کابینت های ایمنی استفاده می شود.